Vsebina predmeta
Študentje oblikujejo skupine po 4-5 študentov z različnim predznanjem (skupine vključujejo študente, ki so zaključili prvostopenski študijski program računalništva in informatike, matematike ali sorodnih študijskih smeri, ter študente, ki so zaključili prvostopenski program študijev, ki preučujejo vede o življenju).
Štirje predavatelji podajo posamezen izziv; štiri izzive skupine rešujejo ločeno. Izzivi so v okviru ene/več vsebin:
- Zajem in vrste signalov pri eksperimentalnem delu.
- Analiza eksperimentalnih podatkov.
- Vizualna predstavitev eksperimentalnih podatkov.
- Biološke in medicinske podatkovne zbirke.
- Spletne strani in programska oprema za analizo podatkov iz zbirk.
- Podatkovne zbirke zaporedij nukleotidov in aminokislin.
- Zaporedje DNA, iskanje vzorcev in skritih sporočil.
- Teorija grafov in branje genoma.
- Primerjava zaporedij nukleotidov in aminokislin, dinamično programiranje in iskanje mutacij.
- Filogenetska analiza.
- Razvrščanje v skupine na podlagi podobnosti, metoda glavnih komponent.
- Določanje fizikalno-kemijskih lastnosti molekule DNA/RNA na podlagi zaporedja nukleotidov.
- Določanje sekundarne strukture RNA.
- Biološko navdahnjene metode: genetski algoritmi, diferencialna evolucija in metode roja.
- Določanje mehanizma in konstante vezave.