Med avtorji odmevne raziskave o toksinih rastlinskih patogenov tudi doc. dr. Nada Žnidaršič z Oddelka za biologijo

29.03.2022

Med avtorji odmevne raziskave o toksinih rastlinskih patogenov tudi doc. dr. Nada Žnidaršič z Oddelka za biologijo

V priznani znanstveni reviji Science Advances (IF=14 .136) zlatega odprtega dostopa, kjer objavljajo najpomembnejše znanstveno raziskovalne dosežke z vseh področij znanosti in inženirstva, je bil marca 2022 objavljen članek z naslovom An oomycete NLP cytolysin forms transient small pores in lipid membranes / Citolitični protein NLP iz oomicete tvori majhne prehodne pore v lipidni membrani. Raziskavo so koordinirali raziskovalci Odseka za molekularno biologijo in nanobiotehnologijo na Kemijskem inštitutu pod vodstvom prof. dr. Gregorja Anderluha. V študiji je sodelovalo 19 raziskovalcev, med njimi tudi iz Biotehniške in Medicinske fakultete Univerze v Ljubljani ter uglednih raziskovalnih ustanov iz Velike Britanije, Japonske, Italije, Finske in Nemčije. Med soavtorji je tudi raziskovalka Biotehniške fakultete doc. dr. Nada Žnidaršič, s Katedre za zoologijo Oddelka za biologijo, ki je izpostavila: »Osrednji rezultat navedene študije je pojasnitev molekulskega mehanizma interakcije proteinov NLP (Nep1-like proteins) z modelno lipidno membrano in s tem razumevanje procesov, s katerimi proteini NLP poškodujejo rastlinske celice. Proteine NLP izločajo pomembni povzročitelji bolezni poljščin in tako poškodujejo rastlinske membrane ter povzročijo propad rastlin. Izsledki raziskave omogočajo razvoj novih strategij za zaščito poljščin. Menim, da je ena od izstopajočih kvalitet navedene raziskave uporaba spektra komplementarnih biokemijskih, biofizikalnih, računalniških in mikroskopskih tehnik ter učinkovita sinteza komplementarnih ekspertiz sodelujočih laboratorijev. Na Biotehniški fakulteti smo s presevno elektronsko mikroskopijo pojasnili ultrastrukturno organizacijo proteinskih skupkov na membrani.« Prva avtorica članka dr. Katja Pirc je doktorirala na Biotehniški fakulteti v raziskovalni skupini prof. dr. Nataše Poklar Ulrih.

Prva avtorica raziskave dr. Katja Pirc, alumna Biotehniške fakultete Univerze v Ljubljani in raziskovalka na Kemijskem inštitutu je ob tem dosežku dejala: »Poškodba rastlinske membrane s strani NLP proteinov je izredno škodljiv proces, zato ga želimo razumeti karseda podrobno. V prihodnje se bomo posvetili preučevanju interakcije več proteinov NLP z rastlinsko membrano, saj želimo ugotoviti ali poškodujejo membrano na podoben način. Velik izziv bo predstavljala tudi določitev strukture pore s krio-elektronsko mikroskopijo«.

Doc. dr. Nada Žnidaršič je predstavila raziskavo, ki je potekala na Oddelku za biologijo Biotehniške fakultete: »V navedeni študiji smo sodelovali z našim znanjem in izkušnjami na področju elektronske mikroskopije bioloških vzorcev. S presevno elektronsko mikroskopijo smo analizirali liposome z vezanim proteinom NLP ter na osnovi pridobljenih mikrografij pojasnili razporeditev proteinskih skupkov v interakciji z modelno membrano, ki je vsebovala rastlinske lipide glikozilinozitol fosforilceramide (GIPC). Mikroskopske tehnike, zlasti sodobne metode fluorescenčne mikroskopije in elektronske mikroskopije, so ključen sestavni del raziskav v znanostih o življenju. Razvoj in učinkovita uporaba različnih mikroskopskih tehnik v prebojnih raziskavah lahko temelji samo na dolgoročni in kontinuirani izgradnji ekspertize ter na intenzivnem sodelovanju laboratorijev, ki razvijajo posamezne tehnike in skupaj omogočajo aplikacijo komplementarnih metod v kompleksnih raziskavah.«

Ultrastrukturne analize bioloških vzorcev s presevno elektronsko mikroskopijo na Oddelku za biologijo Biotehniške fakultete Univerze v Ljubljani

Več informacij v novici na spletni strani Kemijskega inštituta na povezavi

Članek An oomycete NLP cytolysin forms transient small pores in lipid membranes (Katja Pirc, Luke A. Clifton, Neval Yilmaz, Andrea Saltalamacchia, Mojca Mally, Tina Snoj, Nada Žnidaršič, Marija Srnko, Jure Borišek, Petteri Parkkila, Isabell Albert, Marjetka Podobnik, Keiji Numata, Thorsten Nürnberger, Tapani Viitala, Jure Derganc, Alessandra Magistrato, Jeremy H. Lakey, Gregor Anderluh) je dostopen na povezavi