Namen Centra je razvoj poglobljenih znanj in raziskovalnih pristopov na področjih razvojne in varstvene biologije človeških ribic ter njihovega zdravstvenega varstva v naravnem okolju. Ta so ključna za oblikovanje vzdržnega programa vzreje človeških ribic in predstavljajo znanstveno podlago za učinkovito ohranjanje in varovanje človeške ribice in drugih endemičnih jamskih organizmov ter podzemnih ekosistemov. Poleg tega je delovanje Centra usmerjeno v ozaveščanje javnosti o edinstveni biologiji podzemnih organizmov in ranljivosti podzemnega okolja, pomenu znanstveno-raziskovalnega dela za ohranjanje naravne dediščine, ter vključevanje navedenih aktivnosti v pedagoški proces programov Biotehniške fakultete.
Delo Centra poteka pod strokovnim vodstvom sodelavcev BF UL ter v okviru njihovih pristojnosti in pridobljenih dovoljenj za delo z živalmi in raziskovalno delo v podzemnih jamah.